
近日,苏州医科二本大学1、附屬大医院王学浩科学院院士公司在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点能量是什么分解代谢检测分析服务。
用英文怎么说副标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文版问题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业客户企事业单位:南京医科大学
研发涂料:细胞
拜谱带来了服务管理:转录组测序+血清互作组+靶向疗法能量是什么消化吸收组
技艺线路:
研究分析结局
01、YBX1被评定为HCC中糖酵解的重要的基因组
本探究收采HCC恶性肺部肿癌模本(n=7)的单肺部肿癌神经人体细胞RNA测序数剧集去定量进行分析一下,显示糖酵解生物最主要集中化在恶性肺部肿癌肺部肿癌神经人体细胞中,hdWGCNA定量进行分析一下甄别出9个遗传基因控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的经营定量进行分析一下确实YBX1为人格独立经营可能性原则(图1H)。进几步组合IHC、WB实验性和恶性肺部肿癌集体安排与靠近非恶性肺部肿癌集体安排的环境空间转录组学数剧集印证YBX1是肝肺部肿癌神经人体细胞癌制疗的不确定靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被明确为控制HCC肿瘤细胞糖酵解的首要原则
02、YBX1提高HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗体力排泄组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1催进HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1紧密联系并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1相结合并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增強其磷碱化,而使加速其核转位
进两步的骤的检测YBX1的O-GlcNAc糖基化有没有后果其磷过酸,在OGT敲低的HCC上皮细胞核中或用OGT克药制剂OSMI-1办理,YBX1球蛋清总体品质特殊大幅度降低,YBX1磷过酸特殊提高(图4A-C)。IP检测意味着,在相似的Flag-YBX1底物总体品质下,YBX1-WT的磷过酸总体品质特殊不低于YBX1-T57A,意味着磷过酸的加剧往往仅是因更大的YBX1球蛋清表现(图4D)。离心分离了核和质类物质发掘TMG办理的HCC上皮细胞核中YBX1核表现的偏高(图4E-F),进两步的骤发掘YBX1磷过酸的要点改善要素是AKT(图4G-I)。以上发掘着重于O-GlcNAc糖基化使用可以淡化其磷过酸来减弱YBX1球蛋清保持稳定义并可以淡化核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 呈现有益于于其切实骤有磷碱化呈现并还可以有利于促进其核转位
05、YBX1可以淡化PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1加快PKM2转录
06、YBX1 是可以上升组蛋白酶乳碱化呈现程度
论述知道YBX1敲低有明显减小球氨基酸乳过酸,尤其要是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解遏药物制剂2-DG的实验室印证了糖酵解与组球淀粉酶乳过酸的真接相关联,遏制糖酵解可有明显减小H3K18la横向(图6D)。PKM2过抒发可逆反应转YBX1敲低伴发的H3K18la下跌,之外源乳酸除理这不仅提高H3K18la,还引发YBX1抒发调涨,提醒长期存在正向着报告(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR印证,H3K18la完成聚集于YBX1启动服务器子真接带动其转录,该的过程受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并知道P300 调涨是YBX1改善H3K18乳酰化做用的策略(图6K-L)。
图6.YBX1激发H3K18乳硝化作用遮盖平行
论文总结
在类似这些论述中媒体报道了YBX1在HCC中高表示,并与糖酵解开切相应。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,而使平衡高核蛋白质并加剧其表示。类似这些装饰还加速YBX1在T57处的磷碱化,加速其核易位。因,这时促进了糖酵解相应表观遗传的转录并的刺激乳酸的存在。于此,YBX1促活P300的转录,因此驱动包组高核蛋白的乳碱化,十分是H3K18la,H3K18乳碱化双向调空YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隐性基因正反面馈环制度化图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物学为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶点养分分泌组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、血清组学、翻意后体现组学、分解代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
考生论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.